Berdirinya Poliklinik di GKI Pondok Indah berawal dari pemikiran salah seorang jemaat, dr Yudi Budiharja, yang melihat adanya kebutuhan pelayanan kesehatan di lingkungan gereja kita. Pemikiran itu kemudian dikembangkannya dengan dr. Widyaharsana yang pada saat itu menjabat sebagai Ketua Majelis. Setelah mendapat persetujuan Majelis, dr Yudi mengurus semua perizinan yang diperlukan, dan pada akhirnya poliklinik GKI PI resmi dibuka pada tanggal 10 November 1991 oleh alm. Bapak Darma Suria.
Pada awal kegiatannya, dr Julie Widyaharsana diangkat sebagai penanggung jawab poliklinik ini. Badan Pengawas terdiri atas dr. Yudi Budihardja, dr. Okky Hutama dan dr. Kristina R Setiawan, sedangkan Ibu Celly Wijaya menjabat sebagai administrator. Ibu Nyoman Pariasih dan Ibu Ester Martin Naffi diangkat sebagai perawat; dan ibu Tini Sukiyono sebagai tenaga non-medis.
Misi poliklinik GKI PI ialah memberi pelayanan kesehatan dasar yang bermutu dan terjangkau kepada masyarakat di sekitar gereja dan juga kepada jemaat gereja sendiri. Untuk menyukseskan poliklinik ini, selain dokter-dokter yang namanya disebut di atas, beberapa orang jemaat yang berprofesi dokter kemudian ikut melayani. yaitu dr. Debbie Hertiani, dr. Nasution, dr. Nono B. Wyotokusumo, dr. Indri Wilmana, dr. Belinda Nadesul, dr. Iriani Pujiastuti, dr. Francine Luhulima, dr Hanna S. Wibowo dan dr Debora Tjahjadi. dr. Yudi Budihardja sendiri kemudian menjadi penanggung jawab poliklinik ini dari tahun 2001–2006 dan masih tetap melayani sampai saat ini.
Poliklinik GKI PI pernah mengadakan kerjasama dengan Universitas Kristen Indonesia (UKI) dalam pengadaan dokter yang melayani di sana secara silih ganti.
Pada awalnya, tarif pengobatan Rp.500.- Untuk memperkenalkan poliklinik yang baru dibuka ini, masyarakat di sekitar Terogong diberi kupon gratis untuk berobat. Perlahan tapi pasti keberadaan poliklinik ini tidak hanya dikenal di sekitar Pondok Indah saja, tetapi jauh sampai ke Pamulang, Cinere, Cilandak dan Cipete.
Pada tanggal 1 April 2005, pengelolaan poliklinik, baik umum (BPU) maupun gigi (BPG) yang semula berada di bawah Yayasan Kasih GKI PI, dialihkan ke Komisi Pelayanan Kesehatan yang berada di bawah Majelis Bidang Oikumene, yang sekarang disebut Majelis Bidang Kesaksian dan Pelayanan (Mabid. Kespel).
Kini poliklinik ini menjangkau masyarakat yang lebih luas. Bekerja sama dengan Komisi Dikkesra, poliklinik GKI PI melayani sampai ke daerah Teluk Naga, Desa Kemang, Sawangan dll. dalam bentuk Bhakti Sosial yang diberikan secara gratis.
Jadwal buka poliklinik
| Poliklinik Buka Setiap Hari | Senin – Sabtu |
| Pendaftaran | 08.00 – 11.00 |
| Praktek Dokter | 09.00 – 13.00 |
| Praktek sore | Selasa dan Jumat |
| Pendaftaran | 15.00 – 16.00 |
| Praktek Dokter | 16.00 – 18.00 |
